変異株について

一般的にウイルスは増殖や感染を繰り返す中で少しずつ変異していくものであり、新型コロナウイルスも約2週間で1箇所程度の速度で変異していると考えられています。国立感染症研究所（以下、「感染研」という）は、こうした変異をリスク分析し、その評価に応じて、「懸念される変異株（ＶＯＣ）」、「注目すべき変異株（ＶＯＩ）」、「監視下の変異株（ＶＵＭ）」に分類しております。

• 懸念される変異株（ＶＯＣ）

  主に感染性や重篤度が増す、ワクチン効果が減弱するなど、性質が変化した可能性が明らかな株

• 注目すべき変異株（ＶＯＩ）

  主に感染性や重篤度、ワクチン効果などに影響を与える可能性が示唆されるかつ国内侵入・増加するリスク等がある株

• 監視下の変異株（ＶＵＭ）

  主に感染性や重篤度、ワクチン効果などに影響を与える可能性が示唆される、またはＶＯＣやＶＯＩに分類されたもので世界的に検出数が著しく減少等している株

出典）
第109回新型コロナウイルス感染症対策アドバイザリーボード（令和4年12月7日）資料

世界の新型コロナウイルス変異株の発生状況に関する情報については以下のページを参照ください。

東京 i CDCでは、都内での変異株の発生状況を把握するため、「新型コロナウイルスのゲノム解析に関する検討チーム」を立ち上げ、東京都健康安全研究センター（以下、「健安研」という。）や民間検査機関等において、都内における遺伝子変異の有無のスクリーニングを実施するとともに、ゲノム解析を行っています。

ゲノム解析結果の推移は以下のとおりです。

健安研及び民間検査機関等でのゲノム解析及びスクリーニングの過去の実施状況は、以下のとおりです。

オミクロン株に関する情報については以下のページを参照ください

新型コロナウイルス変異株の都内での発生動向を把握し、変異株の広がりの状況をいち早く捉え、効果的な対応につなげるため、健安研にて遺伝子変異の有無のスクリーニングを実施しています。

〇「BA.4系統」「BA.5系統」に対応した変異株ＰＣＲ検査
5月23日からは、「BA.4系統」や「BA.5系統」に対応した変異株ＰＣＲ検査を開始しました。
「BA.2系統」にはない変異「L452R」の有無を確認し、「L452R」の変異がある場合は、「BA.4系統」又は「BA.5系統」の疑いがあります。
「L452R」とともに、膜タンパク質の変異「D3N」の有無を確認し、変異あり（D3N）の場合、「BA.5系統」疑いとなります。変異なし（D3D）の場合、「BA.4系統」疑いとなります。

〇「BA.2.75系統」に対応した変異株ＰＣＲ検査
7月12日以降に受け付けた検体について、「BA.2.75系統」に対応した変異株ＰＣＲ検査を実施しております。「L452R」の変異がなく、「G339H」の変異がある場合、「BA.2.75系統」疑いとなります。

〇「BA.4.6系統」「BF.7系統」に対応した変異株ＰＣＲ検査
10月11日以降に受け付けた検体について、「BA.4.6系統」及び「BF.7系統」に対応した変異株ＰＣＲ検査を開始しました。
「R346T」の変異の有無を確認し、「BA.4」疑いに「R346T」の変異がある場合、「BA.4.6」疑いとなり、「BA.5」疑いに「R346T」の変異がある場合、「BF.7」疑いとなります。
※「BA.4.6」：BA.4系統の亜系統
※「BF.7」：BA.5系統の亜系統

〇「BQ.1.1系統」と「XBB系統」に対応した変異株ＰＣＲ検査
10月28日以降に受け付けた検体について、「BQ.1.1系統」と「XBB系統」に対応した変異株ＰＣＲ検査を開始しました。
「K444T」や「N460K」等の変異の有無を確認し、「BA.5系統」疑いに「K444T」「N460K」「R346T」の変異がある場合は「BQ.1.1系統」疑いとなり、「BA.2.75系統」疑いに「N460K」「R346T」「Q183E」の変異がある場合は、「XBB系統」疑いとなります。
※「BQ.1.1」：BA.5の亜系統
※「XBB」：BA.2とBA.2.75の組換え体

〇「BN.1系統」に対応した変異株ＰＣＲ検査
11月21日以降に受け付けた検体について、「BN.1系統」に対応した変異株ＰＣＲ検査を開始しました。
「R346T」等の変異を確認し、「BA.2.75系統」疑いに「R346T」の変異があり、「Q183E」の変異がない場合、「BN.1系統」疑いになります。
※「BN.1」：BA.2.75の亜系統

〇「XBB.1.5系統」に対応した変異株ＰＣＲ検査
1月16日以降に受け付けた検体について、「XBB.1.5系統」に対応した変異株ＰＣＲ検査を開始しました。
「F486P」の変異を確認し、「XBB系統」疑いに「F486P」の変異がある場合、「XBB.1.5系統」疑いとなります。（「F486S」の変異がある場合は、「XBB系統」疑いとなります）
※「XBB.1.5」：XBB系統の亜系統